煙氣擋板門是用于連接鍋爐系統和FGD系統的設備，它對鍋爐系統和FGD系統的應用都有著極大的影響。煙氣擋板門在FGD系統中多作為FGD系統的入口擋板門、FGD系統出口擋板門及旁路擋板門。
脫硫系統在正常運行的狀態下，煙氣會從鍋爐尾部的除塵器經FGD系統的入口擋板門進入到升壓風機內，而后煙氣在被換熱器降溫后進入吸收塔，脫硫后的煙氣會被煙氣換熱器再加熱到大約80℃，然后經過FGD系統的出口煙氣擋板門進入到煙囪，被排放入大氣。

1、入口擋板門
入口擋板門也被稱為是原煙氣擋板門，它是設置在鍋爐系統和脫硫系統之間的煙氣擋板門。入口擋板門的作用是開啟脫硫系統將煙氣引入FGD系統，和關閉脫硫系統并防止煙氣滲入和滲出FGD系統。

2、出口擋板門
脫硫系統的煙道和煙囪相連，出口擋板門的作用是控制煙道是否向煙囪開放，并防止煙氣滲出煙道。

3、旁路擋板門
脫硫系統內設有旁路煙道，煙道內安裝有旁路煙氣擋板門，它們的作用是在FGD系統檢查、維修或發生異常狀態時，為煙氣提供旁路通道進入煙囪，以保證脫硫系統的安全。脫硫系統的旁路煙道的開啟和關閉都是靠煙氣擋板門來實現的。
煙氣擋板門中用于入口的擋板門，由于所要處理的煙氣溫度較高，因此多是使用碳鋼為主要材質，而用于旁路的煙氣擋板門使用的材質多為不銹鋼和合金鋼。